1、代理记账发展的外部环境不好
随着社会的发展和进步，我们提倡企业把“企业价值最大化”作为企业的财务控制目标。投资者建立企业的目的，在于创造尽可能多的财富。但是很多企业财务管理人员的理财观念滞后、理财知识欠缺、理财方法落后，缺乏掌握知识的主动性和创新精神。同时，企业管理模式也较为陈旧、落后，所有权与经营权的高度统一，并且对于财务管理的理论方法缺乏应有的认识和研究，致使其职责不分，越权行事，造成财务管理混乱，财务监控不严。会计信息失真等。
2、代理记账机构不合法
目前我国存在大量的未办理营业执照和代理记账许可证的不合法群体，他们游离于工商局和财政局监督以外，和客户关系为“你情我愿”的利益关系，国家执法部门不能有效进行监督控制，扰乱了代理记账市场，干扰了法律的严肃性。他们业务素质的参差不齐，也不能保证会计行业的水准符合法律规定。
3、会计基础工作不规范
当前多数企业代理记账会计基础工作不规范，比如人员配备不规范，会计人员素质(包括职业道德、会计专业知识水平)有待于进一步提高。同时会计核算不按要求来做、不规范，原始凭证审核过于形式、原始凭证上单位负责人未审批签名，会计资料存在数据失真现象比如很多企业在代理记账委托过程中，代理记账对象提供的会计原始单据的真实性得不到验证，导致了财务和报表的失真。给信息使用者造成一定的判断失误，给国家造成巨大损失。